Также см. Цвет материала, многие примечание верны и для Прозрачности.
В 3д МАХ, нельзя настроить прозрачность для конкретной текстуры. Т.е. изменение прозрачности будет работать только для всей поверхности покрытой выбранным материалом.
Однако, если, в нифскопе, удалить альфа свойства с объекта и добавить (если ее не было) карту декалей, станет возможным управление прозрачностью только этой карты.